Entre 2016 y 2020, un barco de irregularidades parece haber anclado en la Autoridad Portuaria, según una auditoría realizada por la Contraloría General de La República.
De acuerdo a Víctor Gómez Casanova, quien fue director de la institución durante el periodo 2016-2020, desconoce auditoría realizada en Autoridad Portuaria.